Protein–RNA interactions for Protein: P55083

MFAP4, Microfibril-associated glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP4P55083 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MFAP4P55083 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MFAP4P55083 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MFAP4P55083 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MFAP4P55083 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MFAP4P55083 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MFAP4P55083 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MFAP4P55083 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MFAP4P55083 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MFAP4P55083 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MFAP4P55083 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MFAP4P55083 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MFAP4P55083 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MFAP4P55083 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MFAP4P55083 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MFAP4P55083 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MFAP4P55083 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MFAP4P55083 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MFAP4P55083 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MFAP4P55083 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MFAP4P55083 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MFAP4P55083 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MFAP4P55083 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MFAP4P55083 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MFAP4P55083 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MFAP4P55083 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MFAP4P55083 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MFAP4P55083 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MFAP4P55083 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MFAP4P55083 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms