Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

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Length 987 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHB4P54760 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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