Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB28P51157 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB28P51157 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB28P51157 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB28P51157 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB28P51157 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB28P51157 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB28P51157 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB28P51157 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB28P51157 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB28P51157 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB28P51157 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB28P51157 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB28P51157 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB28P51157 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB28P51157 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB28P51157 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB28P51157 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB28P51157 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB28P51157 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB28P51157 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB28P51157 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB28P51157 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB28P51157 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB28P51157 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB28P51157 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB28P51157 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB28P51157 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB28P51157 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB28P51157 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB28P51157 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB28P51157 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB28P51157 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB28P51157 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB28P51157 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB28P51157 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB28P51157 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB28P51157 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB28P51157 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB28P51157 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB28P51157 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB28P51157 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB28P51157 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB28P51157 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB28P51157 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB28P51157 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB28P51157 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB28P51157 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB28P51157 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB28P51157 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB28P51157 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB28P51157 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms