Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSFMP43897 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TSFMP43897 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSFMP43897 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSFMP43897 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSFMP43897 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSFMP43897 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSFMP43897 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSFMP43897 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSFMP43897 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSFMP43897 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSFMP43897 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSFMP43897 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSFMP43897 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSFMP43897 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSFMP43897 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSFMP43897 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSFMP43897 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSFMP43897 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSFMP43897 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TSFMP43897 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSFMP43897 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSFMP43897 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSFMP43897 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSFMP43897 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSFMP43897 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSFMP43897 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSFMP43897 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSFMP43897 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSFMP43897 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TSFMP43897 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSFMP43897 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TSFMP43897 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSFMP43897 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSFMP43897 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSFMP43897 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TSFMP43897 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSFMP43897 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSFMP43897 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSFMP43897 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSFMP43897 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSFMP43897 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSFMP43897 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSFMP43897 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSFMP43897 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSFMP43897 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSFMP43897 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSFMP43897 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSFMP43897 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSFMP43897 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSFMP43897 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSFMP43897 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSFMP43897 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSFMP43897 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSFMP43897 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSFMP43897 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSFMP43897 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSFMP43897 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSFMP43897 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSFMP43897 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSFMP43897 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSFMP43897 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSFMP43897 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSFMP43897 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSFMP43897 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TSFMP43897 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSFMP43897 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSFMP43897 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSFMP43897 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms