Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSHP23434 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GCSHP23434 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GCSHP23434 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSHP23434 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSHP23434 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSHP23434 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSHP23434 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCSHP23434 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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