Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL3P19876 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms