Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB9P17482 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms