Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRG2P13727 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRG2P13727 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRG2P13727 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRG2P13727 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRG2P13727 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRG2P13727 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRG2P13727 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRG2P13727 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRG2P13727 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRG2P13727 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRG2P13727 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRG2P13727 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRG2P13727 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PRG2P13727 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRG2P13727 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRG2P13727 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRG2P13727 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRG2P13727 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRG2P13727 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRG2P13727 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRG2P13727 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRG2P13727 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRG2P13727 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRG2P13727 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PRG2P13727 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRG2P13727 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRG2P13727 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRG2P13727 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRG2P13727 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRG2P13727 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRG2P13727 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRG2P13727 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRG2P13727 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRG2P13727 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRG2P13727 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRG2P13727 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRG2P13727 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms