Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms