Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FCER1AP12319 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms