Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHGAP10645 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHGAP10645 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHGAP10645 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHGAP10645 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHGAP10645 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHGAP10645 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHGAP10645 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHGAP10645 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHGAP10645 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHGAP10645 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHGAP10645 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHGAP10645 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHGAP10645 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHGAP10645 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHGAP10645 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHGAP10645 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHGAP10645 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CHGAP10645 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHGAP10645 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHGAP10645 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHGAP10645 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHGAP10645 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHGAP10645 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHGAP10645 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHGAP10645 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHGAP10645 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHGAP10645 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHGAP10645 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHGAP10645 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CHGAP10645 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHGAP10645 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHGAP10645 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHGAP10645 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHGAP10645 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHGAP10645 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHGAP10645 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHGAP10645 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHGAP10645 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHGAP10645 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHGAP10645 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHGAP10645 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHGAP10645 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHGAP10645 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHGAP10645 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHGAP10645 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHGAP10645 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHGAP10645 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHGAP10645 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHGAP10645 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHGAP10645 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHGAP10645 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHGAP10645 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHGAP10645 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHGAP10645 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CHGAP10645 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.58■■■□□ 2
CHGAP10645 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CHGAP10645 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHGAP10645 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHGAP10645 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHGAP10645 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHGAP10645 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHGAP10645 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CHGAP10645 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHGAP10645 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHGAP10645 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHGAP10645 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CHGAP10645 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CHGAP10645 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHGAP10645 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHGAP10645 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHGAP10645 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHGAP10645 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms