Protein–RNA interactions for Protein: P0C879

Putative uncharacterized protein FLJ43185, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C879 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P0C879 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P0C879 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P0C879 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P0C879 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P0C879 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P0C879 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P0C879 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P0C879 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P0C879 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P0C879 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P0C879 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P0C879 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P0C879 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P0C879 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P0C879 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P0C879 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P0C879 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P0C879 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P0C879 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P0C879 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P0C879 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P0C879 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P0C879 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P0C879 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P0C879 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P0C879 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P0C879 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P0C879 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P0C879 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P0C879 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P0C879 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P0C879 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P0C879 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P0C879 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P0C879 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P0C879 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms