Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIL1P09327 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIL1P09327 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIL1P09327 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIL1P09327 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIL1P09327 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIL1P09327 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIL1P09327 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIL1P09327 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIL1P09327 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIL1P09327 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VIL1P09327 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VIL1P09327 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIL1P09327 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIL1P09327 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIL1P09327 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIL1P09327 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIL1P09327 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIL1P09327 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VIL1P09327 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VIL1P09327 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VIL1P09327 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VIL1P09327 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VIL1P09327 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VIL1P09327 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VIL1P09327 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VIL1P09327 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VIL1P09327 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VIL1P09327 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VIL1P09327 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
VIL1P09327 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VIL1P09327 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VIL1P09327 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VIL1P09327 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VIL1P09327 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VIL1P09327 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VIL1P09327 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VIL1P09327 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VIL1P09327 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VIL1P09327 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VIL1P09327 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VIL1P09327 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIL1P09327 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIL1P09327 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIL1P09327 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIL1P09327 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIL1P09327 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIL1P09327 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIL1P09327 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIL1P09327 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIL1P09327 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIL1P09327 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIL1P09327 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIL1P09327 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIL1P09327 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIL1P09327 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIL1P09327 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIL1P09327 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIL1P09327 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIL1P09327 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIL1P09327 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIL1P09327 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIL1P09327 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIL1P09327 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VIL1P09327 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIL1P09327 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIL1P09327 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIL1P09327 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIL1P09327 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIL1P09327 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIL1P09327 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIL1P09327 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIL1P09327 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VIL1P09327 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIL1P09327 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIL1P09327 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIL1P09327 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIL1P09327 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIL1P09327 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIL1P09327 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIL1P09327 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIL1P09327 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIL1P09327 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VIL1P09327 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIL1P09327 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIL1P09327 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIL1P09327 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIL1P09327 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIL1P09327 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIL1P09327 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VIL1P09327 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIL1P09327 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIL1P09327 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIL1P09327 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIL1P09327 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VIL1P09327 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIL1P09327 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIL1P09327 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIL1P09327 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VIL1P09327 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms