Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOEP02649 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOEP02649 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOEP02649 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOEP02649 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
APOEP02649 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOEP02649 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOEP02649 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOEP02649 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOEP02649 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOEP02649 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOEP02649 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOEP02649 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
APOEP02649 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOEP02649 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOEP02649 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOEP02649 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOEP02649 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOEP02649 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOEP02649 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOEP02649 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOEP02649 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOEP02649 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APOEP02649 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOEP02649 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APOEP02649 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APOEP02649 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOEP02649 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOEP02649 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOEP02649 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOEP02649 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOEP02649 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOEP02649 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOEP02649 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOEP02649 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOEP02649 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOEP02649 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOEP02649 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOEP02649 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOEP02649 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOEP02649 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOEP02649 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOEP02649 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOEP02649 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOEP02649 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOEP02649 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOEP02649 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOEP02649 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOEP02649 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOEP02649 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOEP02649 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOEP02649 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOEP02649 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOEP02649 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOEP02649 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOEP02649 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOEP02649 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOEP02649 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOEP02649 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOEP02649 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOEP02649 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOEP02649 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOEP02649 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOEP02649 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOEP02649 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOEP02649 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOEP02649 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOEP02649 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOEP02649 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOEP02649 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOEP02649 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOEP02649 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOEP02649 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOEP02649 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOEP02649 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOEP02649 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOEP02649 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOEP02649 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOEP02649 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOEP02649 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
APOEP02649 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOEP02649 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOEP02649 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOEP02649 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOEP02649 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOEP02649 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOEP02649 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOEP02649 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOEP02649 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOEP02649 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOEP02649 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOEP02649 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
APOEP02649 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOEP02649 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOEP02649 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOEP02649 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
APOEP02649 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOEP02649 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOEP02649 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOEP02649 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms