Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

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Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAPGEF3O95398 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
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RAPGEF3O95398 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RAPGEF3O95398 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
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