Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM2O94769 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM2O94769 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM2O94769 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM2O94769 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM2O94769 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM2O94769 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM2O94769 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM2O94769 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM2O94769 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM2O94769 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM2O94769 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM2O94769 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM2O94769 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM2O94769 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM2O94769 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM2O94769 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM2O94769 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM2O94769 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM2O94769 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM2O94769 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM2O94769 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM2O94769 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM2O94769 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM2O94769 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM2O94769 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM2O94769 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM2O94769 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM2O94769 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECM2O94769 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM2O94769 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM2O94769 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM2O94769 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM2O94769 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM2O94769 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM2O94769 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM2O94769 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM2O94769 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM2O94769 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM2O94769 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM2O94769 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM2O94769 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM2O94769 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM2O94769 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM2O94769 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM2O94769 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM2O94769 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM2O94769 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM2O94769 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM2O94769 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM2O94769 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECM2O94769 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM2O94769 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM2O94769 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM2O94769 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM2O94769 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM2O94769 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM2O94769 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM2O94769 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM2O94769 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM2O94769 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM2O94769 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM2O94769 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM2O94769 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM2O94769 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM2O94769 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM2O94769 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM2O94769 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM2O94769 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM2O94769 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM2O94769 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM2O94769 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM2O94769 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM2O94769 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM2O94769 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM2O94769 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECM2O94769 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM2O94769 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM2O94769 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM2O94769 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM2O94769 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM2O94769 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM2O94769 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM2O94769 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECM2O94769 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECM2O94769 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECM2O94769 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM2O94769 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM2O94769 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM2O94769 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM2O94769 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM2O94769 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM2O94769 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM2O94769 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM2O94769 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM2O94769 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM2O94769 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM2O94769 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM2O94769 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM2O94769 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms