Protein–RNA interactions for Protein: O75762

TRPA1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPA1O75762 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPA1O75762 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPA1O75762 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPA1O75762 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPA1O75762 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPA1O75762 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPA1O75762 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPA1O75762 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPA1O75762 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPA1O75762 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPA1O75762 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPA1O75762 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPA1O75762 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPA1O75762 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPA1O75762 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPA1O75762 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPA1O75762 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPA1O75762 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPA1O75762 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPA1O75762 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPA1O75762 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPA1O75762 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPA1O75762 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPA1O75762 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPA1O75762 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPA1O75762 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPA1O75762 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPA1O75762 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms