Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1B3

TRBV30, T-cell receptor beta variable 30 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV30A0A0K0K1B3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV30A0A0K0K1B3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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