Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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RTN1Q16799 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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RTN1Q16799 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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RTN1Q16799 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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RTN1Q16799 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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RTN1Q16799 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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