Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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LAMA3Q16787 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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LAMA3Q16787 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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LAMA3Q16787 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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