Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms