Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms