Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
VPS72Q15906 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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VPS72Q15906 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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VPS72Q15906 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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