Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
HERC1Q15751 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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