Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RYR3Q15413 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms