Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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NKX1-1Q15270 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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NKX1-1Q15270 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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NKX1-1Q15270 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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NKX1-1Q15270 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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NKX1-1Q15270 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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NKX1-1Q15270 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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NKX1-1Q15270 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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NKX1-1Q15270 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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