Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NFIXQ14938 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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