Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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CKAP5Q14008 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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CKAP5Q14008 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
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CKAP5Q14008 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
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CKAP5Q14008 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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CKAP5Q14008 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CKAP5Q14008 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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