Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CDK13Q14004 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CDK13Q14004 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms