Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
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PKP1Q13835 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
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PKP1Q13835 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
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PKP1Q13835 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
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PKP1Q13835 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
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