Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ATMQ13315 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATMQ13315 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATMQ13315 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATMQ13315 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATMQ13315 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATMQ13315 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATMQ13315 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATMQ13315 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATMQ13315 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATMQ13315 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATMQ13315 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATMQ13315 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATMQ13315 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATMQ13315 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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ATMQ13315 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ATMQ13315 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATMQ13315 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.1
ATMQ13315 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
ATMQ13315 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
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