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| PTK7 | Q13308 | OR11H5P-201 | ENST00000554039 | 926 nt | BASIC | 6.04 | □□□□□ -1.44 | | |
| PTK7 | Q13308 | RPL10P14-201 | ENST00000565265 | 298 nt | BASIC | 6.04 | □□□□□ -1.44 | | |
| PTK7 | Q13308 | CHEK2P2-203 | ENST00000566448 | 670 nt | TSL 5 BASIC | 6.04 | □□□□□ -1.44 | | |
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| PTK7 | Q13308 | AC060780.2-201 | ENST00000589047 | 198 nt | BASIC | 6.04 | □□□□□ -1.44 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC104662.1-201 | ENST00000604448 | 511 nt | BASIC | 6.04 | □□□□□ -1.44 | | |
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| PTK7 | Q13308 | LINC01416-201 | ENST00000563553 | 2310 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.04 | □□□□□ -1.44 | | |
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| PTK7 | Q13308 | LINC00824-203 | ENST00000520206 | 2055 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.03 | □□□□□ -1.44 | | |
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| PTK7 | Q13308 | MIR548A1HG-201 | ENST00000636739 | 558 nt | TSL 4 BASIC | 6.03 | □□□□□ -1.44 | | |
| PTK7 | Q13308 | FKBP7-204 | ENST00000424785 | 2834 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 6.03 | □□□□□ -1.44 | | |
| PTK7 | Q13308 | FAM229B-201 | ENST00000368656 | 2543 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.03 | □□□□□ -1.44 | | |
| PTK7 | Q13308 | CD226-201 | ENST00000280200 | 12319 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 6.03 | □□□□□ -1.44 | | |
| PTK7 | Q13308 | SRGAP1-201 | ENST00000355086 | 23331 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.03 | □□□□□ -1.44 | | |
| PTK7 | Q13308 | KDM4C-214 | ENST00000536108 | 3406 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.03 | □□□□□ -1.44 | | |
| PTK7 | Q13308 | SLC13A1-201 | ENST00000194130 | 3815 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.03 | □□□□□ -1.44 | | |
| PTK7 | Q13308 | MAK-204 | ENST00000536370 | 3767 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.03 | □□□□□ -1.44 | | |
| PTK7 | Q13308 | LINC01289-201 | ENST00000519550 | 3712 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.02 | □□□□□ -1.45 | | |
| PTK7 | Q13308 | BBIP1-207 | ENST00000448814 | 2119 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.02 | □□□□□ -1.45 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL049830.3-201 | ENST00000555108 | 1991 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.02 | □□□□□ -1.45 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL451142.2-201 | ENST00000429076 | 2090 nt | BASIC | 6.02 | □□□□□ -1.45 | | |
| PTK7 | Q13308 | EPC2-201 | ENST00000258484 | 3649 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.02 | □□□□□ -1.45 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-1188P-201 | ENST00000363795 | 107 nt | BASIC | 6.02 | □□□□□ -1.45 | | |
| PTK7 | Q13308 | IGLV7-43-201 | ENST00000390298 | 385 nt | APPRIS P1 BASIC | 6.02 | □□□□□ -1.45 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-821P-201 | ENST00000390995 | 107 nt | BASIC | 6.02 | □□□□□ -1.45 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-550P-201 | ENST00000391057 | 101 nt | BASIC | 6.02 | □□□□□ -1.45 | | |
| PTK7 | Q13308 | RN7SKP279-201 | ENST00000411383 | 298 nt | BASIC | 6.02 | □□□□□ -1.45 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC096921.1-201 | ENST00000411661 | 375 nt | BASIC | 6.02 | □□□□□ -1.45 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR3681HG-202 | ENST00000412606 | 578 nt | TSL 5 BASIC | 6.02 | □□□□□ -1.45 | | |
| PTK7 | Q13308 | AF241725.1-201 | ENST00000416182 | 480 nt | TSL 3 BASIC | 6.02 | □□□□□ -1.45 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL591719.2-201 | ENST00000437400 | 386 nt | TSL 3 BASIC | 6.02 | □□□□□ -1.45 | | |
| PTK7 | Q13308 | LINC00969-211 | ENST00000438608 | 525 nt | TSL 5 BASIC | 6.02 | □□□□□ -1.45 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC068491.2-201 | ENST00000438897 | 617 nt | TSL 2 BASIC | 6.02 | □□□□□ -1.45 | | |
| PTK7 | Q13308 | TBX18-AS1-202 | ENST00000441863 | 382 nt | TSL 2 BASIC | 6.02 | □□□□□ -1.45 | | |
| PTK7 | Q13308 | EIF4A1P11-201 | ENST00000451239 | 222 nt | BASIC | 6.02 | □□□□□ -1.45 | | |
| PTK7 | Q13308 | GAS5-223 | ENST00000452197 | 483 nt | TSL 3 BASIC | 6.02 | □□□□□ -1.45 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC091685.2-201 | ENST00000454924 | 864 nt | BASIC | 6.02 | □□□□□ -1.45 | | |
| PTK7 | Q13308 | SCARNA18-201 | ENST00000459004 | 134 nt | BASIC | 6.02 | □□□□□ -1.45 | | |