Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms