Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CSTF3Q12996 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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