Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
BNIP3Q12983 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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