Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
FOXF2Q12947 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXF2Q12947 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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