Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
NFIAQ12857 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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