Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.4□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
BPTFQ12830 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
BPTFQ12830 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.3 ms