Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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