Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDE4DQ08499 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PDE4DQ08499 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms