Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
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PGGT1BP53609 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
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PGGT1BP53609 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
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PGGT1BP53609 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
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PGGT1BP53609 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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PGGT1BP53609 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
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PGGT1BP53609 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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