Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SHOC2Q9UQ13 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143 ms