Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
ATG3Q9NT62 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATG3Q9NT62 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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