Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SMG1Q96Q15 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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