Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TMUB2Q71RG4 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms