Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms