Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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CDO1Q16878 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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CDO1Q16878 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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CDO1Q16878 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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CDO1Q16878 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDO1Q16878 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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