Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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PTPROQ16827 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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PTPROQ16827 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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PTPROQ16827 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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PTPROQ16827 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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PTPROQ16827 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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PTPROQ16827 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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PTPROQ16827 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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PTPROQ16827 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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PTPROQ16827 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPROQ16827 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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