Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms