Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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